Guru-guru yang mengajar di SMP Sw. St. Fransiskus kebanyakan guru-guru yang masih muda yang mempunyai semangat dan daya juang yang tinggi dan masih segeeer. Data tersebut adalah :
1. Drs. Beatus Halawa
Kepala Sekolah tahun pelajaran 1997 – 1998, mutasi thn 1998
2. Damialus Buaton, S.Pd
Wakil Kepala Sekolah tahun pelajaran 1997 – 1998, kepala sekolah tahun pelajaran 1998 – 2011, mutasi thn 2011
3. Janner Naibaho, S.Pd.
Wakil Kepala Sekolah tahun pelajaran 2002 – 2011. Kepala Sekolah tahun pelajaran 2011 – sekarang.
4. Solima Lase, S.Pd.
Wakil Kepala Sekolah tahun pelajaran 1998 – 2002. Mengundurkan diri tahun 2002
